- Inti atom berwarna merah mencerminkan bahwa semua mahasiswa merupakan satu kesatuan
- Lima Elektron berwarna merah mencerminkan bahwa HIMAFI FMIPA UNEJ berasaskan Pancasila
- Lingkaran bertuliskan Himpunan Mahasiswa Fisika (HIMAFI) mencerminkan bahwa Mahasiswa Fisika diwadahi oleh HImpunan Mahasiswa Fisika(HIMAFI)
- Orbit elektron berbentuk elips usaha pantang menyerah
- Dasar lambang berwarna putih mencerminkan kejujuran dan rendah hati